原来国会议员南来参加护法的只有一百余人，召集正式国会不足法定人数。便借用民国二年议院法第七条“议员于开会后满一个月尚未到院者，应解其职”之规定，把没有南来的参、众两院议员解职，然后由候补议员递补，凑足法定人数。
护法军政府成立后，段祺瑞要下命令通缉孙中山和非常国会议长吴景濂。
冯国璋不肯签署命令，只同意由北京检察厅以“背叛民国”罪提起公诉，由司法机关行文全国，通缉孙中山。
段坚持要直接下通缉令，冯不想因这件事把两个人的关系搞得太僵，于九月二十九日，很不情愿的签署通缉令。
护法军政府也下令通缉段祺瑞、梁启超、汤化龙、倪嗣冲四人，以资报复。
段祺瑞第二次组阁后，雄心勃勃的想真正统一中国。他没把广东的军政府放在眼里，倒是很高兴能给他一个名正言顺的出兵理由。尤其在借款有着落后，更急于对南方佣兵。
段的用兵计划准备由四川进攻云南和贵州，由湖南进攻两广。
在四川进展不理想的情况下，湖南就成了唯一的选择。
湖南距离北洋派的占领区最近，本身实力不强，是个理想通道。
段祺瑞正在琢磨派谁去当湖南督军时，听到有湖南人喊出“湘人治湘”的口号。
在北京的湖南著名人士，如熊希龄、范源濂等也主张湘人治湘，维持现状，反对北军入湘。
这倒使段想起一个人来，就是傅良佐。傅良佐是湖南人，又是他的铁杆，是既可满足“湘人治湘”，又可以由自己人督湘，何乐而不为。
于是发表他最宠信的傅良佐为湖南督军，仍命谭延闿为湖南省长，同时明确表示傅良佐虽督湘，但不带北兵入湘。 。
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